預防衣原體感染的根本措施在要提倡安全性行為（包括安全套的使用），杜絕非婚性接觸，潔身自好。病人在患病期間不從事可能擴散疾病的職業，如保育員、護理及浴室工作等。在醫院及托兒所等處，如發現工作人員患病及入托幼兒有外陰陰道炎，要注意觀察。為防止間接傳染應分開使用體溫表，對浴室、毛巾及床單等應進行消毒。

　　為預防性伴間相互感染，性伴任何一方患有本病未徹底治療之前，應避免性生活，若有性生活則必須使用安全套，并應嚴格分開使用毛巾、臉盆、床單等可致傳染的物品；污染物可煮沸消毒或使用消毒劑。

　　避孕措施可改變沙眼衣原體感染的傳播和并發癥的發生。不使用任何避孕方法或使用安全期避孕法對感染不起任何保護作用。使用屏障避孕法（如安全套），如方法正確且堅持使用，可使衣原體感染率降低一半以上。陰道隔膜加殺精劑也可起一定的保護作用。而口服避孕藥可能增加生殖道沙眼衣原體感染的易感性。因此使用安全套等屏障式避孕措施是預防生殖道沙眼衣原體感染的有效方法。

　　在體外，衣原體的生存能力差，衣原體對熱敏感，其傳染性在６０℃１０分鐘完全喪失，在３７℃４８小時內即顯著下降，在４℃僅能良好存活約２４小時。在室溫下，乙醚３０分鐘、０.１％福爾馬林２４小時以內、０.５％石炭酸２４小時以內，均可完全滅活衣原體。因此，煮沸或使用化學消毒劑很容易將沙眼衣原體殺滅。此外，許多市售的消毒劑（包括洗液和噴霧劑）也能有效殺滅體外的沙眼衣原體。

　　總之，生殖道沙眼衣原體感染是一種性病，可引起尿道炎、宮頸炎等多種臨床表現，導致不育癥、異位妊娠等后果，并可通過母嬰傳播而影響優生優育。同時，這種疾病的治療效果很好，而且個人預防也并不困難。

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